Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pank2Q3U4S0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pank2Q3U4S0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pank2Q3U4S0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pank2Q3U4S0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 382.7 ms