Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TraddQ3U0V2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TraddQ3U0V2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms