Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy4Q3TYX8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rufy4Q3TYX8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy4Q3TYX8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy4Q3TYX8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy4Q3TYX8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy4Q3TYX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy4Q3TYX8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy4Q3TYX8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms