Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd4Q3TT99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdpd4Q3TT99 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms