Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctdnep1Q3TP92 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctdnep1Q3TP92 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms