Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43aQ3TL54 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43aQ3TL54 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim43aQ3TL54 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms