Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RubcnlQ3TD16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RubcnlQ3TD16 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RubcnlQ3TD16 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RubcnlQ3TD16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms