Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Specc1lQ2KN98 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Specc1lQ2KN98 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms