Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH17

Trim72, Tripartite motif-containing protein 72, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim72Q1XH17 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trim72Q1XH17 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim72Q1XH17 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim72Q1XH17 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms