Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 LEU5YHR002W 1074 nt8.29□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 PGU1YJR153W 1086 nt8.29□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 MRPS16YPL013C 366 nt8.29□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 TKL2YBR117C 2046 nt8.28□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 DPH5YLR172C 903 nt8.27□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 ECM15YBL001C 315 nt8.27□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 IES2YNL215W 963 nt8.27□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 MCH2YKL221W 1422 nt8.26□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 YPT1YFL038C 621 nt8.26□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 FBA1YKL060C 1080 nt8.26□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt8.26□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 CYB2YML054C 1776 nt8.26□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 TMT1YER175C 900 nt8.25□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 PRO3YER023W 861 nt8.24□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 YNL296WYNL296W 315 nt8.24□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 TAH11YJR046W 1815 nt8.24□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 NOB1YOR056C 1380 nt8.24□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 NDC1YML031W 1968 nt8.23□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 RPS9AYPL081W 594 nt8.23□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 YDR415CYDR415C 1125 nt8.21□□□□□ -1.09
DNF3Q12674 GSH1YJL101C 2037 nt8.21□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 EEB1YPL095C 1371 nt8.21□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YGR176WYGR176W 348 nt8.21□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YNR014WYNR014W 639 nt8.21□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 CIS3YJL158C 684 nt8.2□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 BBP1YPL255W 1158 nt8.2□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 EFM1YHL039W 1758 nt8.2□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 UTR2YEL040W 1404 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 PKC1YBL105C 3456 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 SLO1YER180C-A 258 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YKL151CYKL151C 1014 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 OPI8YKR035C 642 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YLR123CYLR123C 330 nt8.19□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 AMD1YML035C 2433 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 GIR2YDR152W 798 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 GTT3YEL017W 1014 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YJR107WYJR107W 987 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 TIM54YJL054W 1437 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 ORC5YNL261W 1440 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 COX16YJL003W 357 nt8.18□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 YAP1801YHR161C 1914 nt8.17□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 DAL82YNL314W 768 nt8.17□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 ATG4YNL223W 1485 nt8.17□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 SMK1YPR054W 1167 nt8.16□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 SRF1YDL133W 1314 nt8.16□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 MIP1YOR330C 3765 nt8.15□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 GGC1YDL198C 903 nt8.15□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 QNS1YHR074W 2145 nt8.15□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 WHI2YOR043W 1461 nt8.15□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 GPH1YPR160W 2709 nt8.15□□□□□ -1.1
DNF3Q12674 RTT106YNL206C 1368 nt8.15□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 KTR1YOR099W 1182 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 HDA1YNL021W 2121 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 YDR154CYDR154C 351 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 NTG1YAL015C 1200 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 YJR115WYJR115W 510 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 TOS6YNL300W 309 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 SAM4YPL273W 978 nt8.14□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 APE3YBR286W 1614 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 SHM1YBR263W 1473 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 MCM3YEL032W 2916 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 RTG2YGL252C 1767 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 RFC1YOR217W 2586 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 MRPL4YLR439W 960 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 ATO2YNR002C 849 nt8.13□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 HSX1tR(CCU)J 72 nt8.12□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 RCL1YOL010W 1104 nt8.12□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 YBR144CYBR144C 315 nt8.12□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 RPL21AYBR191W 483 nt8.12□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 FAA4YMR246W 2085 nt8.11□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 RPT6YGL048C 1218 nt8.11□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 MIM2YLR099W-A 264 nt8.11□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 RPL5YPL131W 894 nt8.11□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 YDL034WYDL034W 345 nt8.11□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 IPK1YDR315C 846 nt8.1□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 CAD1YDR423C 1230 nt8.1□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 YKR032WYKR032W 315 nt8.1□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 GUD1YDL238C 1470 nt8.09□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 KIN1YDR122W 3195 nt8.09□□□□□ -1.11
DNF3Q12674 YCL065WYCL065W 369 nt8.08□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YLR118CYLR118C 684 nt8.08□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 PAD1YDR538W 729 nt8.08□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 HHY1YEL059W 309 nt8.08□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YHM2YMR241W 945 nt8.08□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YGL235WYGL235W 537 nt8.07□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YBR016WYBR016W 387 nt8.07□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YOR318CYOR318C 306 nt8.07□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 MHR1YDR296W 681 nt8.06□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt8.06□□□□□ -1.12
DNF3Q12674 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 266.7 ms