Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc138Q0VF22 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms