Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rundc1Q0VDN7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rundc1Q0VDN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rundc1Q0VDN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rundc1Q0VDN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms