Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MitfQ08874 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MitfQ08874 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MitfQ08874 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MitfQ08874 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MitfQ08874 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MitfQ08874 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms