Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Padi2Q08642 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Padi2Q08642 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Padi2Q08642 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms