Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfdp1Q08639 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfdp1Q08639 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms