Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnma1Q08460 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnma1Q08460 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnma1Q08460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms