Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax5Q02650 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax5Q02650 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax5Q02650 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms