Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Htr1fQ02284 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Htr1fQ02284 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms