Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Yy1Q00899 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Yy1Q00899 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Yy1Q00899 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yy1Q00899 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Yy1Q00899 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms