Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gfra1P97785 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra1P97785 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms