Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis3P97368 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis3P97368 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis3P97368 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Meis3P97368 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis3P97368 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Meis3P97368 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms