Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cbx1P83917 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx1P83917 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms