Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn5P68500 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn5P68500 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn5P68500 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms