Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sumo1P63166 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sumo1P63166 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo1P63166 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms