Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz1P61924 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz1P61924 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz1P61924 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz1P61924 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Copz1P61924 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz1P61924 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz1P61924 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms