Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Depdc5P61460 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Depdc5P61460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Depdc5P61460 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Depdc5P61460 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Depdc5P61460 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Depdc5P61460 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Depdc5P61460 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Depdc5P61460 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms