Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d1P61080 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms