Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P58686 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P58686 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P58686 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P58686 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P58686 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P58686 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P58686 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P58686 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P58686 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P58686 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P58686 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P58686 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P58686 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P58686 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P58686 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P58686 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P58686 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P58686 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P58686 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P58686 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P58686 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P58686 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P58686 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P58686 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
P58686 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P58686 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P58686 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P58686 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P58686 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P58686 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P58686 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P58686 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P58686 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P58686 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P58686 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P58686 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P58686 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P58686 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P58686 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P58686 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P58686 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P58686 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P58686 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P58686 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P58686 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P58686 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P58686 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P58686 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P58686 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P58686 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P58686 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P58686 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P58686 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P58686 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P58686 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P58686 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P58686 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P58686 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms