Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp5P56399 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp5P56399 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp5P56399 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp5P56399 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp5P56399 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp5P56399 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp5P56399 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp5P56399 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp5P56399 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp5P56399 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms