Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad23bP54728 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad23bP54728 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad23bP54728 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rad23bP54728 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms