Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HdgfP51859 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HdgfP51859 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HdgfP51859 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HdgfP51859 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HdgfP51859 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HdgfP51859 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HdgfP51859 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HdgfP51859 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HdgfP51859 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HdgfP51859 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HdgfP51859 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HdgfP51859 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HdgfP51859 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HdgfP51859 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HdgfP51859 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HdgfP51859 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HdgfP51859 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HdgfP51859 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HdgfP51859 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HdgfP51859 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HdgfP51859 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.3 ms