Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LifrP42703 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LifrP42703 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LifrP42703 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LifrP42703 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LifrP42703 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LifrP42703 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LifrP42703 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LifrP42703 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LifrP42703 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LifrP42703 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LifrP42703 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LifrP42703 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LifrP42703 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LifrP42703 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LifrP42703 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LifrP42703 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LifrP42703 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LifrP42703 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LifrP42703 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LifrP42703 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LifrP42703 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LifrP42703 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LifrP42703 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LifrP42703 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LifrP42703 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LifrP42703 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LifrP42703 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LifrP42703 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LifrP42703 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LifrP42703 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LifrP42703 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LifrP42703 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LifrP42703 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LifrP42703 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LifrP42703 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LifrP42703 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LifrP42703 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LifrP42703 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LifrP42703 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LifrP42703 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LifrP42703 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LifrP42703 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LifrP42703 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LifrP42703 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LifrP42703 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LifrP42703 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LifrP42703 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LifrP42703 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LifrP42703 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LifrP42703 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms