Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl28P41105 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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