Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppm1bP36993 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppm1bP36993 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppm1bP36993 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppm1bP36993 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppm1bP36993 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppm1bP36993 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppm1bP36993 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms