Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdha1P35486 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms