Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Hoxc11P31313 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc11P31313 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms