Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa2P31245 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms