Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprmP28828 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprmP28828 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprmP28828 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprmP28828 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprmP28828 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprmP28828 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprmP28828 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprmP28828 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprmP28828 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprmP28828 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprmP28828 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprmP28828 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprmP28828 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprmP28828 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprmP28828 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprmP28828 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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