Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BgnP28653 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BgnP28653 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BgnP28653 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BgnP28653 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BgnP28653 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BgnP28653 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BgnP28653 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BgnP28653 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BgnP28653 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BgnP28653 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BgnP28653 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BgnP28653 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BgnP28653 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BgnP28653 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BgnP28653 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BgnP28653 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BgnP28653 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BgnP28653 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BgnP28653 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BgnP28653 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BgnP28653 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BgnP28653 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BgnP28653 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BgnP28653 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BgnP28653 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BgnP28653 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BgnP28653 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BgnP28653 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BgnP28653 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BgnP28653 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BgnP28653 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BgnP28653 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BgnP28653 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BgnP28653 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BgnP28653 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BgnP28653 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BgnP28653 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BgnP28653 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BgnP28653 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BgnP28653 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BgnP28653 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BgnP28653 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BgnP28653 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BgnP28653 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BgnP28653 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BgnP28653 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BgnP28653 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BgnP28653 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BgnP28653 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BgnP28653 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BgnP28653 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BgnP28653 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BgnP28653 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BgnP28653 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BgnP28653 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BgnP28653 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BgnP28653 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BgnP28653 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BgnP28653 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BgnP28653 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BgnP28653 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BgnP28653 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BgnP28653 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BgnP28653 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BgnP28653 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BgnP28653 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BgnP28653 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BgnP28653 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BgnP28653 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BgnP28653 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BgnP28653 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BgnP28653 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BgnP28653 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BgnP28653 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BgnP28653 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms