Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Itgb7P26011 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb7P26011 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb7P26011 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb7P26011 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms