Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf239P24399 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf239P24399 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf239P24399 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms