Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd8P23463 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd8P23463 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd8P23463 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms