Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PenkP22005 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PenkP22005 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PenkP22005 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PenkP22005 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PenkP22005 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PenkP22005 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PenkP22005 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PenkP22005 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PenkP22005 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PenkP22005 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PenkP22005 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PenkP22005 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PenkP22005 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PenkP22005 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PenkP22005 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PenkP22005 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PenkP22005 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PenkP22005 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PenkP22005 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PenkP22005 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PenkP22005 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PenkP22005 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PenkP22005 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PenkP22005 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PenkP22005 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PenkP22005 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PenkP22005 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PenkP22005 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PenkP22005 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PenkP22005 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PenkP22005 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms