Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ms4a1P19437 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a1P19437 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a1P19437 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms