Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RargP18911 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RargP18911 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RargP18911 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RargP18911 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RargP18911 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RargP18911 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RargP18911 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RargP18911 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RargP18911 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RargP18911 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RargP18911 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RargP18911 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RargP18911 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RargP18911 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RargP18911 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RargP18911 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RargP18911 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RargP18911 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RargP18911 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RargP18911 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RargP18911 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RargP18911 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RargP18911 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RargP18911 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RargP18911 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RargP18911 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RargP18911 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RargP18911 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RargP18911 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RargP18911 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RargP18911 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RargP18911 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RargP18911 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RargP18911 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RargP18911 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RargP18911 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RargP18911 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RargP18911 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RargP18911 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RargP18911 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms