Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ca3P16015 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ca3P16015 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ca3P16015 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ca3P16015 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ca3P16015 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ca3P16015 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ca3P16015 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ca3P16015 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ca3P16015 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ca3P16015 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ca3P16015 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ca3P16015 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms