Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Q9P14431 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-Q9P14431 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Q9P14431 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms