Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnp2P11378 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnp2P11378 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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