Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd4P10628 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd4P10628 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms