Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Amd1P0DMN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amd1P0DMN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms